| 管理职能处室 |
综合部 |
作为院的综合事务管理部门，承担的职能模块包括文秘、会议管理、制度文件管理、印章管理、公文管理、后勤管理、固定资产管理、车辆管理、信息管理及网络维护等工作。 |
| 人力资源部 |
作为院的人力资源管理部门，承担的职能模块包括人力资源管理、会议管理、制度文件管理，品牌管理等工作。 |
| 市场经营部 |
作为院的市场营销和投资管理部门，承担的职能模块包括全院市场统筹管理、客户管理、投标管理、合同管理、产值下达、备案管理和资质管理等工作。 |
| 技术质量部 |
作为院的技术质量管理部门，承担的职能模块包括三体系管理、技术质量评定及专业协调、科研学术活动管理、档案管理，协助市场经营部资质管理等工作。 |
| 财务部 |
作为院的财务管理部门，承担的职能模块包括财务管理、预算管理、会计核算与报表管理、审计监察管理、成本管理、税务管理、资金管理以及应收账款管理等工作。 |
| 党群工作部 |
作为院的党务管理部门，承担的职能模块包括党务工作、共青团老干及妇女工作、制度文件管理，新闻宣传、品牌管理等工作。 |
| 辅助生产处室 |
文印服务部 |
作为院的生产辅助科室，承担的职能模块包括负责文件、资料、设计成果的扫描、复印、打印、晒图、装订等工作。 |
| 媒体工作室 |
作为院的生产辅助科室，承担的职能模块包括制作设计成果效果图、PPT和汇报片等工作。 |
| 专业技术处室 |
水工处 |
水工处下设水工一室、水工二室、水工三室，作为院的生产部门，承担院水利业务技术质量管理和生产管理等工作。 |
| 水电处 |
水电处下设机电信息化室、结构室（含三维设计），作为院的生产部门，承担院水电、数字化等业务技术质量管理和生产管理等工作。 |
| 规划处 |
规划处下设水文水资源室、水生态环境室、规划室，作为院的生产部门，承担院水文、水环境、规划等业务技术质量管理和生产管理等工作。 |
| 施工预算室 |
作为院的技术质量管理部门，承担的职能模块主要包括勘察、测绘管理和实验管理工作。 |
| 勘测处 |
勘测处下设土工试验室、地勘大队、测绘大队，作为院的技术质量管理部门，承担的职能模块主要包括勘察、测绘管理和实验管理工作。 |